人体内有三种滴虫宿主：口腔毛滴虫、人体毛滴虫(肠道内宿主)和阴道毛滴虫。阴道毛滴虫主要侵入人体泌尿生殖系统，可寄生于女性外阴皮肤、尿道旁腺、下尿道、前庭腺、阴道、宫颈管的皱褶处；在男性中，阴道毛滴虫主要存在于尿道和前列腺。

人体内的另外两种滴虫并不通过病毒感染阴道。一般来说，一些健康女性阴道内有阴道毛滴虫，但不会引起炎症反应。

可能是阴道环境继续不适合滴虫生长，也可能是病毒感染株毒力弱所致。但当阴道环境再次发生变化，不利于滴虫的生长时，就可能引起滴虫性阴道炎。滴虫性阴道炎是育龄妇女罕见的阴道炎症，患病率次于霉菌性阴道炎。

滴虫病可通过性生活或间接知识传播。游泳池和浴池，尤其是水池和池塘，可以减少到滴虫病传播的地方。母亲也有可能将滴虫病传染给新生儿。

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